남경필 교수는 1998년 미국 코넬대학교에서 박사학위를 취득하고 2003년 본 학부에 부임 한 이래 지금까지, 각종 유해화학물질(유류, 중금속, 방사능물질 등)로 오염된 환경오염지역을 정화 및 관리 분야의 연구를 학문적 수월성과 현장 적용성을 모두 고려하면서 수행하고 있다. 특히, 국내 최초로 ‘위해성에 근거한 환경오염부지 평가, 정화, 및 관리’라는 개념을 도입하고, 그 학문적, 기술적 토대를 완성하였으며, 이를 통하여 기존 굴토-제거 위주의 환경정화에서 벗어나 환경오염부지를 과학적으로 평가를 하고 정화-관리하는 공학적인 최적 솔루션을 제공하고 있다.

구체적인 연구분야로는 ①오염물질의 토양에서의 이동과 거동이 생물학적 이용성과 복원기술의 효율성에 미치는 영향에 관한 연구, ②생물회복기술(Bioremediation)의 효율성 증대에 관한 연구, ③복합오염물질의 효율적 처리를 위한 물리, 화학, 생물학적 하이브리드기술의 개발, ④생명공학적 기법을 이용한 환경오염문제 해결 및 환경적 친화적 신물질 생산(생분해성 플라스틱, 바이오연료 전구물질 등) 등이 있다.